Brain Lights up Mind

目的：从原始的MRI文件读取该序列的扫描信息，可以是各个模态，只要原始数据能够用MRIcro软件打开，因为这个骚操作就是用MRIcro解决。 注意是用MRIcro软件而不是用MRIcroN软件： image.png 首先是打开MRIcro软件，打开原始文件，比如.IMA文件。 image.png image.png image.png 如下图，就可以看到了，就是这么简单方便。MRIcro软件虽小，但五脏俱全，还有很多骚操作等你发掘。 image.png 20190228

image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png image.png 学习记忆是大脑最基本也是最重要的高级神经功能之一，一般认为，学习主要是指人或动物通过神经系统接受外界环境信息而影响自身行为的过程， 记忆是指获得的信息或经验在脑内贮存和提取（再现）的神经活动过程， 二者密切相关。记忆的生物学基础称之为记忆痕迹。学习记忆已经成为神经科学、心理学和精神病学领域的研究热点之一， 对其机制的理解将有助于神经科学家们探索脑的奥秘。大脑是如何执行如此复杂的过程的呢？是整个大脑都参与了学习记忆过程， 还是存在着一些与学习记忆相关的脑区？20 世纪著名的神经心理学家Lashiey 〔1〕认为脑内不存在记忆相关的特殊结构， 记忆痕迹是弥漫存在于脑内的， 记忆功能的受损程度受脑损害范围的影响大于受位置的影响。这个理论统治了神经科学领域近半个世纪。1957年，Scoviiie 〔2〕报道了一例因双侧内侧颞叶切除而造成严重的近期记忆丧失的病例， 神经科学家们开始相信不同的脑部结构在学习记忆中扮演着不同的角色。以后几十年里， “内侧颞叶记忆系统”的概念逐渐形成，其它一些脑区，如前额叶、杏仁核和Meynert基底核（Basainucieusof Meynert ，MBN）等也相继被证实参与了学习记忆过程，纹状体边缘区是舒斯云等在研究大鼠脑时在新纹状体内侧边缘发现的一个与学习记忆有关的新区。 1 内侧颞叶记忆系统： 内侧颞叶记忆系统 由海马及相邻有关皮层组成 ， 包括 内嗅皮层、外嗅皮层和海马旁回等 ...

常常可以看到DARTEL 但又不了解， 今天天气好，挖掘下。先说下DARTEL是个什么东西。 image.png DARTEL是Diffeomorphic Anatomical Registration Through Exponentiated Lie Algebra (DARTEL, Ashburner 2007)的缩写，是一种配准方法，DARTEL工具包可实现高维的变形过程，它增加了个体间的配准，从而提高了分析的定位和灵敏度。 再结合一个PPT深入了解下 Voxel-Based Morphometry 和 DARTEL ： PPT来源于这里： image.png VBM都不陌生，是基于体素的形态学测量，VBM的应用也很多。许多科学或者临床上感兴趣的问题与大脑的某些脑区体积有关系，比如大脑形态测量的局部模式可以帮助区分不同的组(如精神分裂症患者和健康对照组)；也有助于解释在发展和老龄化过程中所看到的变化；还可以寻找结构性的关联(比如分数、特征、遗传学等等)。 可以看个具体的例子，比如下图所示的VBM与利他行为的研究，Morishima等人在2012年的研究发现颞顶交界区（TPJ）的灰质体积的个体差异不仅转化为总体利他行为倾向的个体差异，而且还在大脑结构和大脑功能之间建立了联系。 image.png 再举几个具体的研究例子： image.png image.png VBM的组织分割：高分辨率核磁共振成像揭示了大脑中精细的结构细节，但并非所有这些都是可靠或有趣的。比如会存在Noise, intensity-inhomogeneity, vasculature等的情况存在。 image.png VBM本质上是区域分割组织密度或体积的统计参数映射。灰质密度或体积的准确解释是复杂的，取决于所使用的预处理步骤。它不能解释为神经元的堆积密度或其他细胞结构的组织性质，但好消息是这些微观性质的变化可以导致宏观或中观的VBM可检测到的差异。 image.png 接下来用一些slides来全面了解一下VBM研究： image.png image.png ...