查看dicom原始文件的分辨率

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在处理DTI数据时需要对原始图像重新采样为2mm X 2mm X 2mm大小的体素，因此需要知道原始数据中的体素大小。
方法：使用MRIcroN软件
步骤：
用MRIcron打开.dcm或者.IMA文件，依次在Window-Information-Spacing中即可找到。
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20190522

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如何下载Internet Archive中借阅类图书【详细指南】

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目标 ：下载Internet Archive中的借阅类图书。 问题分析 ： Internet Archive中的书一般历史久远，注册后只能借阅，不太方便。 测试 ： 使用一些在线工具尝试acsm转pdf文件，未果。 转为借由acsm文件间接下载的方式。 亲测能用的方法 ： 1.下载图书对应的acsm文件，方法为 修改url的链接 ，acsm文件很小，为2KB左右； 2.安装Adobe Digital Edition； 3.通过Adobe Digital Edition打开acsm文件，此时可以找到电脑中产生了一个你想要的图书的pdf文件，但因为是加密的，无法用正常的pdf阅读软件打开，接着进行下一步； 4.安装calibre，注意安装5.0版本之前的版本，因为最新版本不支持DeDRM插件； 5.安装完calibre软件后再下载[DeDRM插件]( Releases · apprenticeharper/DeDRM_tools (github.com) )，这里要 注意 下载对应适配calibre版本的DeDRM版本，下载后解压缩，并按照"首选项-插件-从文件加载插件"的步骤加载该插件； 6.DeDRM插件安装成功后接着用calibre打开加密的pdf文件，加载完毕，问题已搞定，通过calibre找到图书的pdf文件存放位置，会发现可以用正常的pdf阅读软件正常打开了。 参考链接： 1.reddit中给出的方法： (1) In archive org, some books can only be borrowed for 1 hour, these types of books do not have a download button as usual, does anyone know how to download these kind of books? : libgen (reddit.com) 2.下载图书的acsm文件： internet archive一小时借阅限制破解 - ericfoner (@ericfoner) (matters.news) 2.艺术史图书馆公众号给出的教程： Internet Archive中借阅类图书的下载和破解方法 (qq.com) 3.解决calibre安装DeDRM插件的问题： DeDRM_too...
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写在月初

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十二月的第一天，下午做核磁，今天核磁没有任务，晚上协同朋友来到学校附近的某健身房观摩，小小练习，很多器材初看都不会，但是参照器材旁边的指南，很快就可学会如何使用。在跑步机上小跑一小会儿，身体就开始出汗，刚刚出汗是激发身体活力的时刻，朋友在教练的讲解下练习每个动作，我也偶尔在旁学习。随后检测了下体脂，整体不错，但需要增肌。虽然器材不少，我还是最喜欢在大自然中锻炼的感觉，不过近日北京的雾霾依然很严重，在户外锻炼是很不适合的，又没有很多时间去健身房，如果是好天气，我一定会选择在户外运动。 今日没有睡午觉，身体有些疲惫，但内心斗志昂扬啊，做核磁时看到清华一哥们拍的记录生活的视频很是励志，曾经的我也是那样，如今那样的日子却少之又少，哥们的视频仿佛对我有一丝触动，也与我的想法不谋而合。晚上可以早睡，但在最好的年纪，早起是一个很好的习惯。对于大多数人来说，晚上熬到很晚似乎比别人拥有了更多时间，但是效率却很低很低，高效的做法是找到适合自己的睡眠时间，早睡，然后早起，只要保持睡眠时间足够，将会迎来精力充沛的一天，我亲身体验也是如此。所以，anyway，早睡早起是要立马行动的。 再一个就是锻炼的重要性，心流可能是最好的状态了，而体育锻炼、激活身体可能是最好的达到心流的方式了，我本身身体素质不错，再结合坚持锻炼、合理饮食，应该会练的很好。而我也渐渐爱上了健身。还需要改变吗？需要，逐渐克服一些不好的生活习惯，以最好的状态和生活谈恋爱。当然，与小伙伴一起锻炼也是一个不错的选择。 月初第一天，如日出之阳。 20181201
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毫不优雅地把各个模态杂乱无章混在一起的DICOM文件独立划分出来

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话不多说，之前已经写过一篇文章讲述如何分类各个模态DICOM文件（ http://www.xuwenhe.name/2019/01/niftidicom.html ），也提到了如果对于转完格式后不好分类的情况，可以在对dicom原始文件读取模态相关的信息，然后分类。因此，把拖了很久的一堆数据在今天下午写了简单的代码把需要的T１、DTI和REST分出来。过程不难，但是文件夹的层次结构比较多，需要注意下。 主要用到的还是pydicom包里的read_file函数 pydicom.read_file 和 SeriesDescription 属性。 比如， dcm = pydicom.read_file( '文件名,比如abc.dcm' ,force= True ) # 输出dcm或者IMA文件的模态信息 print (dcm.SeriesDescription) #如果不知道SeriesDescription是描述模态信息，可以先完全输出dcm，在里边可以找到描述模态对应的标签名。 实际上，如果你对一个DICOM文件夹内存放的文件毫无头绪时，比如这样： image.png 有一个很好的小软件  RadiAnt DICOM Viewer  可以帮你读取DICOM数据并可以把详细信息读取出来，当然也包括模态信息。 很有趣的一点是RadiAnt这个软件读取出来的模态信息名字跟上边用pydicom读取出来的一样，追本溯源殊途同归。 如下图，就是用  RadiAnt DICOM Viewer  读取出来的界面： image.png 具体过程分为两步，第一步是新建文件夹为分类后的模态信息找好居住地，这一步用到的代码如下： #!/usr/bin/env python #coding=utf-8 import os import shutil import re def extract_file (path_name) : # make new directory # directory_name = ['t1','t2','rest','dti','tof','aa...
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